改訂第2版　バイオデータベースとウェブツールの手とり足とり活用法

改訂第2版　
バイオデータベースとウェブツールの手とり足とり活用法

―目次―

序
掲載サイトの使用目的別分類図から自分にあったサイトを探そう
本書を読む前に知っておきたい重要用語

第１章　キーワードによる検索，文献，文書データ
No.1　医学・生物学研究のための検索エンジン活用
No.2　PubMed【
No.3　特許電子図書館：IPDL

第２章　ゲノム・核酸配列解析 
No.4　NCBI-BLAST
No.5　The UCSC Genome Browser
No.6　GeneMarkTMおよびGIimmer3
No.7　DBTSS/TRANSFAC（MATCH）
No.8　Ensembl（Ensembl Genome Browser）
No.9　HapMap Project（International HapMap Project）

第３章　タンパク質配列解析
●1．類似検索
No.10　NCBI Protein BLAST
●2．マルチプルアラインメント
No.11　DDBJにおけるCLUSTALW【
●3．モチーフ・プロファイル検索
No.12　InterProScan【
●4．タンパク質の細胞内局在化予測
No.13　PSORT
NO.14　SOSUI，TMHMM
●5．高次構造・比較分類
NO.15　Protein Data Bank japan（PDBj）
No.16　SCOP（Structural Classification of Proteins）

第４章　発現プロファイル・パスウェイ解析・プロテオミクス
●1．発現プロファイル
No.17　GO
No.18　GEO
No.19　GNF SymAtlas
●2．パスウェイ
No.20　KEGG PATHWAY
No.21　Reactome
●3．プロテオミクス
No.22　ExPASy Proteomics tools
No.23　Mascot

第５章　マテリアル系
●1．試薬・化合物データベース
No.24　ChemIDplusおよびPubChem
No.25　KEGG LIGAND【
●2．バイオリソースデータベース
No.26　National BioResource Project：NBRP
No.27　ATCCR　The Global Bioresource Center

付　録　役立つウェブサイト集